تقوم الهيئة العليا للأدوية بعدد من الأنشطة والتي تهدف إلى حماية الصحة العامة في اليمن وتشمل:
- ترخــــيص عمليـات تصنيـع الأدوية والمستلزمات والأجـــهزة الطبيــــــــة واستـــيرادها وتصـــديرها وتوزيعها وترويجها والإعلان عنها
- التحقق من مأمونية المستحضرات الصيدلانية وفعـــــاليتها وجودتها وإصدار التراخيص لتسويقهــــــا
- تـــفتــــيش مصــــانع الادويـــة والتأكد من مطـــــــــــــــابـــــقتها لـــــــــشروط التصنيع الجيد ومســــــتودعات الأدوية والمستلزمات والأجهزة الطبية
- مراقبة الأدوية والمستلزمات والأجهزة الطبية المتداولة في السوق والتحقق من جودتها وفاعليتها ومأمونيتها ومنع وسائل التسويق غير المشروعة
- رصد ومراقبة الآثار الضارة التي قد تنجم عن تناول واستخدام الأدوية والمستلزمات والأجهزة الطبية
- التحقق من سلامة مستحضرات التجميل ذات الأثر الطبي
- بناء علاقة فاعلة مع الجهات الرقابية المحلية والإقليمية والدولية والجمعيات والمؤسسات العلمية
- التوعية والتثقيف الدوائي للمجتمع
- وضع الأنظمة واللوائح والمواصفات اللازمة قبل السماح بتسويق الأدوية والمستلزمات والأجهزة الطبية في اليمن
- فحص الأدوية و المستلزمات الطبية في مختبرات رقابة الجودة التابع للهيئة العليا للأدوية قبل وبعد تسويقها للتأكد من جودتها و سلامتها
- إيصال الرسائل الصحية والمعلومات الموثقة عن الأدوية والمستلزمات والأجهزة الطبية للمهنيين والجمهور